Analyse af generne i en virus hos mink går lynhurtigt på Computerome.
Af
Plasmacytose er en sygdom hos mink, der forringer pelskvaliteten. Ph.d. Emma Hagberg har hos Copenhagen Fur udviklet en metode, hvor hun kortlægger generne i den virus, der forårsager sygdommen.
Arbejdet med at analysere dataene er krævende. Tidligere brugte Emma Hagberg sin egen computer til opgaven. Det tog syv timer at kortlægge et genom.
Efter hun fik sit projekt godkendt som et nationalt eScience-pilotprojekt hos DeiC, har hun kørt beregningerne på Computerome. Den opgave, der før tog syv timer, kan nu klares på et kvarter.
I videoen fortæller Emma Hagberg om sine erfaringer med at bruge Computerome, DeiCs nationale life-science-supercomputer.
Læs mere
- DeiC indbyder til pilotprojekter på supercomputer
- DeiC Nationale LifeScience Supercomputer, DTU
- Brug af supercomputing - Computerome, artikel fra DeiC eScience Vidensportal
- Sådan får du adgang til Computerome, artikel fra DeiC eScience Vidensportal