I denne måneds nyhedsbrev bringer vi to videoer, der på hver sin måde viser værdien af supercomputeren Computerome: En forsker undersøger en virussygdom hos mink. Et forskerhold bruger computerkraften til at finde sammenhænge mellem gener og psykiske lidelser hos mennesker.
Medlemmer af DeiCs tekniske referencegruppe for supercomputere, HPC TekRef, besøgte i efteråret supercomputerkonferencen SC15. Vi bringer deres rapport fra studieturen.
Hvis du har lyst til at holde et indlæg eller stå for en Birds of a Feather-session på efterårets DeiC konference, er det nu, du skal melde dig!
Nyhedsbrevet sendes også på mail til tilmeldte abonnenter. Du kan til- og afmelde dig nyhedsbrevet pr. mail på denne side:
Video: Forsker analyserer syge mink med supercomputer
Plasmacytose er en sygdom hos mink, der forringer pelskvaliteten. Ph.d. Emma Hagberg har hos Copenhagen Fur udviklet en metode, hvor hun kortlægger generne i den virus, der forårsager sygdommen.
Arbejdet med at analysere dataene er krævende. Tidligere brugte Emma Hagberg sin egen computer til opgaven. Det tog syv timer at kortlægge et genom. Nu kan hun gøre det på et kvarter takket være DeiC Nationale LifeScience Supercomputer ved DTU, Computerome.
Video: Forsker analyserer syge mink med supercomputer
DeiC konference indkalder præsentationer og BoF’s
Efterårets DeiC konference 2016 indbyder interesserede til at holde præsentationer eller stå for Birds of af Feather-arrangementer.
Konferencens tema er ”Nye veje til eScience”. Den er opdelt i fire spor:
- Net og tjenester
- HPC (supercomputer)
- Datamanagement
- Leverandører
Har du lyst til at stå for en præsentation, er du velkommen til at kontakte programkomiteen.
DeiC konferencen er en oplagt mulighed for at møde andre med samme interesser. I år er der åbnet for Birds of a Feather (BoF).
En BoF er en konference i konferencen, hvor folk med interesse for et bestemt emne mødes og diskuterer det. Hvis du er interesseret i at afholde en BoF eller måske blot har et forslag til et interessant emne, kan du også kontakte os.
Aarhus Universitet opretter eScience-udvalg
På Aarhus Universitet har eScience fået sit eget udvalg, der skal sikre koordinering og vidensdeling på tværs af fakulteterne.
Universitetet definerer eScience som forskningsdatamanagement og adgang til supercomputere.
Aarhus Universitet opretter eScience-udvalg
Udvalg ser nyeste supercomputer-teknologi
Repræsentanter fra fem danske universiteter har i USA set ny og kommende teknologi inden for supercomputere. Det skete på konferencen ACM/IEEE Supercomputing Conference 2015 (SC15), der fandt sted i november.
En del af nyhederne blev givet under klausul, så dem må konferencedeltagerne ikke fortælle om, før produkterne er frigivet. For eksempel hørte de om AMD's kommende serverprocessorer i Opteron-serien med kodenavnet Zen, samt om kommende teknologier fra Intel.
Udvalg ser nyeste supercomputer-teknologi
Japan og GÉANT samarbejder om testmiljø
Det japanske forskningsinstitut NICT (National Institute of Information and Communications Technology in Japan) vil samarbejde med GÉANT om forskningsnetteknologier.
De to organisationer har underskrevet en aftale, der blandt andet omfatter sammenkobling af GÉANT Testbed Service og NICT’s tilsvarende testmiljø. Der skal også arbejdes på interoperabilitet mellem de to testsystemer.
Japan og GÉANT samarbejder om testmiljø
Video: Computerome finder sammenhæng mellem genetik og psykiske lidelser
Forskere analyserer DNA-data om 80.000 danskere for at finde frem til sammenhænge mellem gener og psykiske lidelser. DeiCs nationale life-science-supercomputer Computerome ved DTU behandler dataene og beskytter dem mod at komme i de forkerte hænder.
Video: Computerome finder sammenhæng mellem genetik og psykiske lidelser
Udbud om opgradering af forskningsnettet starter forfra
Udbuddet om fornyelse af det optiske transmissionsudstyr på forskningsnettet gik i gang den 4. december 2015 med en prækvalifikationsrunde. Der var færre ansøgere end ventet, og de er efter DeiCs mening ikke repræsentative for hele den bredde, som findes på markedet for DWDM-udstyr (Dense Wavelength Division Multiplexing). Derfor er udbuddet aflyst. Et nyt udbud følger senere.
Udbud om opgradering af forskningsnettet starter forfra
PRACE åbner central for software til supercomputere
PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe) står bag initiativet PRACE CodeVault. Det er en åben platform, hvor brugere af supercomputere kan udveksle programeksempler, stumper af kode, proof-of-concept-kode og andet.
Den nye programcentral indeholder undervisningsmateriale fra PRACE-partnere og eksempler på programkode til udbredte supercomputertyper.
PRACE åbner central for software til supercomputere
DeiC årshjul 
For at sikre sammenhæng i de strategiske og administrative opgaver i DeiC arbejder vi efter et årshjul. Årshjulet viser sammenhængen mellem bestyrelsens, ledelsens og organisationens opgaver inden for
- Strategi, strategiske handlingsplaner, drifts- og projekthandleplaner.
- Budget og opfølgning.
- Information - årsrapport, interne informationsmøder, møder med interessenter og den årlige konference.
Til kalenderen
DeiC eScience Vidensportal tilbyder en løbende oversigt over seminarer og konferencer om eScience. Nedenfor følger et aktuelt udpluk, hele listen kan ses her:
eScience Vidensportal | Aktiviteter
CBioVikings Pitch competition for DeiC National LifeScience Supercomputer
tor 03 Mar | København, Studenterhuset, Aquarium.
tir 15 Mar | Oslo, Norway
DHN would like to receive submissions for papers, posters, project presentations, panels and thematic sessions from all disciplines within the Arts and Humanities as well as from neighboring disciplines, e.g. the social sciences, anthropology, computer science, and library and information science....
ons 06 apr | København - se nærmere i opslaget.
New developments in video technology – potentials and challenges for researchers in the humanities
tir 12 apr | AAU - se opslaget
PRACE Scientific and Industrial Conference
tir 10 maj | Prague, Czech Republic
The conference will bring together experts from academia and industry who will present their advancements in HPC-supported science and engineering. The Call for Contributions is open from 2 November through 29 November 2015, 12:00 (noon) CET
What have we learned from five years of Computational Humanities?
fre 20 maj | Amsterdam, Holland
On 20 May 2016, we will be holding a one-day event to mark the end of the ‘Computational Humanities’ projects. During the morning, members of each of the project teams will present key findings and provide hands-on sessions so that we can all explore the data, tools and results they have developed...
Annual Digital Humanities Conference 2016
tir 12 jul | Kraków, Poland
Digital Humanities 2016 conference will take place in Kraków, Poland; this is only the second time (after Debrecen 1998) that the conference comes to Central/Eastern Europe. The region’s rich past and its recent rapid growth has inspired the conference theme, ‘Digital Identities: the Past and the...
Øvrige konferencer
International konference om forskningsnet arrangeret af GÉANT.
12.-16. juni 2016, Prag, Tjekkiet
Gratis kurser til speciale-/ph.d.-studerende via PRACE
Danmarks medlemskab af PRACE giver mulighed for gratis kurser for studerende og forskere på danske institutioner.
Øvrige kurser og seminarer
Danske ph.d.-kurser kan findes i en fælles database på PhD Courses in Denmark. Søg fx. på "computing" eller "datamanagement".
Nationale kurser
CLARIN-DK: Kurser inden for digital humaniora og CLARIN-EU: Events
DigHumLab: Kurser inden for digital humaniora
Kurser om jura og ophavsret
Ophavsretten får større og større betydning for både forskere og undervisere. Udvalget til Beskyttelse af Videnskabeligt Arbejde (UBVA) udbyder en række relevante kurser.
Kurser om forskning, etik og jura
Kurser om ophavsret, databaser og licensaftaler
Følg DeiC på de sociale medier
Du kan også følge DeiC via LinkedIn, Facebook og Twitter.
Vi deler små og store nyheder og aktiviteter fra ind- og udland, os selv og samarbejdspartnere.